O Comitê Orientador do Fundo Amazônia - COFA, tem a atribuição de determinar suas diretrizes e acompanhar os resultados obtidos.

Ao COFA cabe ainda o papel de zelar pela fidelidade das iniciativas apoiadas pelo Fundo Amazônia, pela determinação de suas diretrizes de aplicação dos recursos, em conformidade com as metas, compromissos e políticas do Plano de Prevenção e Controle do Desmatamento na Amazônia Legal – PPCDAM e das diretrizes estratégicas do Plano Amazônia Sustentável – PAS.

Trata-se de um comitê tripartite, formado de três blocos: governo federal, governos estaduais e sociedade civil. Cada bloco tem direito a um voto nas deliberações. Cada membro tem direito a um voto dentro de seu bloco. 

Composição do COFA

Governo Federal:

Além do MMA (que o preside) e do BNDES, participam do Comitê os ministérios do Desenvolvimento, Indústria e Comércio, das Relações Exteriores, da Agricultura, Pecuária e Abastecimento, do Desenvolvimento Agrário, da Ciência e Tecnologia, a Casa Civil, e a Secretaria de Assuntos Estratégicos da Presidência da República.

Governos Estaduais:

Os representantes governos dos nove estados da Amazônia Legal integram o Comitê, embora só tenham direito a voto os que tiverem elaborado seus planos de prevenção e combate ao desmatamento.

Sociedade Civil:

Estão representados o Fórum Brasileiro de ONGs e Movimentos Sociais para o Meio Ambiente e o Desenvolvimento (Fboms) - do qual o Instituto Socioambiental (ISA) faz parte - , a Coordenação das Organizações Indígenas da Amazônia Brasileira (Coiab), a Confederação Nacional dos Trabalhadores na Agricultura (Contag) e a Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC), além da Confederação Nacional da Indústria (CNI) e o Fórum Nacional das Atividades de Base Florestal (FNABF).  

 Os membros do COFA tem mandato de dois anos, prorrogável uma vez por igual período. 

Composição:

Bloco	Entidade	Titular	Suplente
Governo Federal	Ministério do Meio Ambiente	Izabella Teixeira	Mauro Oliveira Pires
	Ministério do Desenvolvimento, Indústria e Comércio Exterior	Alexandre Comin	Demétrio Florentino de Toledo Filho
	Ministério das Relações Exteriores	André Odenbreit Carvalho	Maximiliano da Cunha Henriques Arienzo
	Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento	Caio Tibério Dornelles da Rocha	Erikson Camargo Chadoha
	Ministério do Desenvolvimento Agrário	Marco Aurélio Pavarino	César José de Oliveira
	Ministério da Ciência e Tecnologia	Carlos Afonso Nobre	Carlos Alfredo Joly
	Casa Civil da Presidência da República	Rodrigo Lofrano Alves dos Santos	Leiza Martins Mackay Dubugras
	Secretaria de Assuntos Estratégicos da Presidência da República	Cibele Fernandes Dias Knoerr	Arnaldo Carneiro Filho
	Banco Nacional de Desenvolvimento Econômico e Social - BNDES	Elvio Lima Gaspar	Sergio Eduardo Weguelin Vieira
Estados Amazônicos	Acre	Carlos Edegard de Deus	Carlos Ovídio Duarte Rocha
	Amapá	Juliano del Castilo Silva	Fabrício de Paula Santos Gomes
	Amazonas	Nádia Cristina D’Avila Ferreira	João Henrique Talocchi
	Maranhão	Fábio Gondim Pereira da Costa	Maria Olindina Medeiros Moreira
	Mato Grosso	Vicente Falcão de Arruda Filho	Ernandy Maurício Bacarat de Arruda
	Pará	Teresa Lusia Mártires Coelho Cativo Rosa	Maria de Nazaré Imbiriba Mitschein
	Rondônia	Nanci Maria Rodrigues da Silva	Francisco de Sales Oliveira dos Santos
	Roraima	Sérgio Pillon Guerra	Luis Emi de Souza Leitão
	Tocantins	Divaldo José da Costa Rezende	Alexandre Tadeu de Moraes Rodrigues
Sociedade Civil	Fórum Brasileiro de ONGs e Movimentos Sociais para o Meio Ambiente e o Desenvolvimento - FBOMS	Adriana Ramos	Joana Carlos Bezerra
	Coordenação das Organizações Indígenas da Amazônia Brasileira - COIAB	Lúcio Paiva Flores	Joênia Batista de Carvalho
	Confederação Nacional da Indústria - CNI	Justiniano de Queiroz Netto	Mário Augusto de Campos Cardoso
	Fórum Nacional das Atividades de Base Florestal - FNABF	Geraldo Bento	Ramiro Azambuja da Silva
	Confederação Nacional dos Trabalhadores na Agricultura - CONTAG	Rosicléia dos Santos	Eliziário Noé Boeira Toledo
	Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência - SBPC	Helena Bonciani Nader	Ennio Candotti

* Aguardando Indicação

Reuniões do COFA

As reuniões do COFA são consignadas em Registros de Encaminhamento Técnico – RETs.

• RET da 1ª   Reunião do COFA, 24.10.2008
• RET da 2ª   Reunião do COFA, 19.11.2008
• RET da 3ª   Reunião do COFA, 29.05.2009
• RET da 4ª   Reunião do COFA, 07.08.2009
• RET da 5ª   Reunião do COFA, 21.09.2009
• RET da 6ª   Reunião do COFA, 03.12.2009
• RET da 7ª   Reunião do COFA, 26.03.2010
• RET da 8ª   Reunião do COFA, 23.06.2010
• RET da 9ª   Reunião do COFA, 19.08.2010
• RET da 10ª Reunião do COFA, 24.11.2010
• RET da 11ª Reunião do COFA, 27.10.2011

Regimento Interno e Diretrizes do COFA

• Regimento Interno do Comitê Orientador do Fundo Amazônia
• Tabela Resumo das Diretrizes e Critérios do COFA